De 5 ultieme wetenschappelijke Linux-distributies

Advertentie

Tijd voor een popquiz: wat zijn wetenschappelijke Linux-distributies?

Het antwoord ligt voor de hand: hoewel de meeste Linux-distributies algemeen zijn, worden sommige gespecialiseerde geleverd met bepaalde soorten software. Er zijn bijvoorbeeld mediacenter-distributies 5 geweldige Linux Media Center-distributies om uw tv te transformeren Lees verder , degenen die van uw computer een multimediaproductiestudio maken, en zelfs een paar religieuze distro's De meest interessante religieuze distro's voor LinuxDe creativiteit en vrijheid van het Linux-platform stelt elke ontwikkelaar in staat om zijn eigen overtuigingen te verkennen anderen voorzien van een besturingssysteem dat is voorgeladen met de beste tools voor religieuze observatie die Linux nodig heeft aanbod. Lees verder . Als je dat weet, zou het je niet moeten verbazen dat er wetenschappelijke Linux-distributies bestaan. Ten slotte, de geschiedenis van Linux Penguin Origins: The History of Linux [Geek History]Er is vrijwel geen plek waar je naartoe kunt gaan zonder in contact te zijn met Linux - het voedt alles, van gewone computers tot de krachtigste servers tot onze draagbare mobiele apparaten. De meeste mensen die geen techneuten zijn ...

Lees verder begon in onderzoekslaboratoria en vandaag Linux voedt de servers Linux is overal: 10 dingen die je niet wist, werden aangedreven door PenguinAls je denkt dat de wereld op Windows rust, denk dan nog eens goed na. Linux speelt een cruciale rol om onze wereld draaiende te houden. Lees verder en werkstations van 's werelds grootste onderzoeksorganisaties.

Simpel gezegd, wetenschappelijke distributies bieden vooraf geïnstalleerde software voor verschillende onderzoeksdoeleinden. Natuurlijk kun je je gewone Ubuntu veranderen in een wetenschappelijke distro door dezelfde apps te installeren, maar het doel van dergelijke distributies is om te voorkomen dat je op zoek gaat naar individuele applicaties. In plaats daarvan bieden ze een snelle manier om Linux te implementeren in onderzoeksfaciliteiten, onderwijsinstellingen en op pc's van studenten en wetenschappelijk nieuwsgierige gebruikers. Als je een van de laatste bent, zijn hier vijf geweldige wetenschappelijke distributies om te overwegen.

Deze groen gekleurde distro is bedoeld voor wetenschappers die werken in bio-informatica - een interdisciplinair vakgebied dat moleculaire biologie en genetica combineert met statistieken en analysemethoden van de computer wetenschap. Bio-Linux, ontwikkeld door het Environmental Omics Synthesis Centre in het VK, wordt ondersteund en gefinancierd door het Centre for Ecology & Hydrology (CEH) en de Natural Environment Research Council (NERC).

Het is een op Ubuntu gebaseerde distributie die alleen beschikbaar is voor 64-bits systemen en het biedt twee desktopomgevingen: standaard eenheid en MATE als lichtgewicht alternatief Een overzicht van MATE: is het een echte GNOME 2-replica voor Linux?De wereld van Linux-desktopomgevingen is sindsdien drastisch veranderd. Gnome 3 werd geboren, Gnome 2 werd in wezen opzij gegooid, Gnome 3 werd gevorkt om Cinnamon te maken, enzovoort. Gnome ... Lees verder . De nieuwste versie (8.0.5) garandeert langdurige ondersteuning dankzij de Ubuntu 14.04-kern. Bio-Linux 8 bevat letterlijk honderden bioinformatica-tools, zowel op de opdrachtregel als grafisch. Om u op weg te helpen, biedt Bio-Linux aanbiedingen een pdf-gids.

Software-hoogtepunten: Artemis, een DNA-sequentie-viewer en annotatie-app; Galaxy, een browsergebaseerd biomedisch onderzoekplatform; Fasta, voor het doorzoeken van DNA- en eiwitdatabases; Mesquite, voor evolutionaire biologie; njplot, voor het tekenen van fylogenetische bomen, en Rasmol, voor het visualiseren van macromoleculen. Als u pakketten van Bio-Linux op uw Ubuntu-systeem wilt installeren, kunt u dat eenvoudig doen voeg hun opslagplaatsen toe.

Bio-Linux is gratis beschikbaar als een Live image en als een OVA-bestand voor het geval je het in VirtualBox wilt uitvoeren.

Alternatief: BioSLAX, een op Slackware gebaseerde wetenschappelijke distributie gericht op bio-informatica en ontwikkeld aan de National University of Singapore.

Net als Bio-Linux heeft Poseidon Linux ook een kleurenschema: zachte blauwe tinten die overeenkomen met de mariene naam. De branding is geïnspireerd door oceanologen die aan het project werken, maar Poseidon Linux is niet voor slechts één tak van wetenschap. In plaats daarvan biedt het een breed scala aan tools, van 2D- en 3D-visualisatie, genetica en programmeer-apps tot ondersteuning voor statistieken, numerieke modellering en mapping.

Poseidon Linux is het resultaat van een transatlantische samenwerking tussen de Rio Grande Federal University in Brazilië en het MARUM Institute in Duitsland. De huidige stabiele versie (4.0) loopt achter op de tijd, omdat deze is gebaseerd op Ubuntu 10.04. Poseidon 5.0 is echter in ontwikkeling en belooft langdurige ondersteuning (afhankelijk van Ubuntu 12.04) en Eenheid als de standaard desktopomgeving - een welkome upgrade van de oude GNOME 2.30 die bij Poseidon wordt geleverd 4.0.

Software-hoogtepunten: Lab Plot, voor interactieve grafieken en data-analyse; QCAD, voor 2D-tekening; Blender, voor 3D-modellering, en QGIS, een compleet geografisch informatiesysteem.

Jij kan download Poseidon Linux gratis in zowel 32- als 64-bits edities.

Alternatief: Als je alleen tools voor geografie en kaarten nodig hebt, probeer het dan OSGeo, een in Lubuntu gebaseerd product van de Open Source Geospatial Foundation.

3. CAElinux

De aanwijzing zit in de naam: CAE staat voor Computer-Aided Engineering en deze wetenschappelijke distro is perfect voor iedereen die werkt met CAD, modellering, prototyping, 3D-printen en fysica-simulaties. CAElinux, ontwikkeld in Zwitserland, is gebaseerd op Xubuntu 12.04 en vereist een 64-bits systeem. Het biedt geen desktop-smaken behalve Xfce, maar de softwareselectie is indrukwekkend.

Software-hoogtepunten: Salome, voor 3D CAD en meshing; GMSH, voor geometriemodellering; Scilab, voor wiskundig programmeren; Paraview, voor 3D-visualisatie; ImageJ, voor beeldverwerking en analyse, en Elmer, voor complexe fysieke modellen.

CAElinux is gratis beschikbaar als Live DVD-image, of u kunt een fysieke kopie bestellen voor een betaalbare prijs.

Alternatief: Als je niet alle geavanceerde engineeringsoftware nodig hebt en gewoon wat 3D-modelleer- en animatietools wilt, probeer dan ArtistX, dat we hebben in detail besproken ArtistX: de Linux-distributie op maat van elke artiest, grafisch of muzikaal Lees verder .

Na al deze * op buntu gebaseerde distributies is Scientific Linux een echte combo-breaker: het is een herbouw van Red Hat Enterprise Linux. De nieuwste versie (7.1, met codenaam Stikstof) kwam onlangs uit, in drie smaken: KDE, GNOME en IceWM 8 geweldige alternatieve desktopmanagers voor Linux Lees verder —Alleen voor 64-bit systemen. De basis is echter niet het enige waardoor Scientific Linux opvalt. In tegenstelling tot andere distributies die vol zitten met wetenschappelijke software, biedt Scientific Linux slechts een basispakket aan apps. Wat een stiekeme, misleidende distro!

Nou niet echt. Wetenschappelijke Linux is in feite ontwikkeld door wetenschappers van het Fermi National Accelerator Laboratory en de Europese Organisatie voor Nucleair Onderzoek (CERN). Hoewel het standaard niet veel wetenschappelijke toepassingen biedt, zijn er tientallen direct beschikbaar in de repository's. Met out-of-the-box codecs en draadloze ondersteuning is Scientific Linux een uitstekende keuze voor een wetenschappelijke omgeving waarin van alles verwacht wordt dat het functioneert zonder al te veel sleutelen. Gebruikers kunnen alleen de software installeren die ze nodig hebben, zodat hun systeem niet vol zit met apps die ze nooit zullen openen.

Software-hoogtepunten: PostgreSQL en MySQL, voor databases en applicatie-ontwikkeling; GNU Emacs teksteditor; R programmeertaal; Frysk, voor systeemanalyse en monitoring, en gnuplot, voor het plotten van wiskundige uitdrukkingen. (Houd er rekening mee dat sommige van deze apps niet standaard worden geïnstalleerd, maar u kunt ze uit de opslagplaatsen halen.)

Scientific Linux kan worden gedownload als een Live dvd-afbeelding.

Alternatief: De ontwikkelaars van Scientific Linux moedigen het maken van "spins" of builds aan op basis van hun project. Een zo'n distro is Fermi Linux; een goede, op beveiliging gerichte optie voor degenen die Scientific Linux op een 32-bits systeem willen gebruiken.

Deze Fedora-spin vertegenwoordigt de middenweg tussen een zeer gespecialiseerde en een gewone Linux-distributie. Als zodanig is het geweldig voor onderzoekers en studenten met alle wetenschappelijke achtergronden, hoewel het enigszins voorstander is van numeriek onderzoek. De standaard desktopomgeving is KDE en Fedora Scientific is beschikbaar voor zowel 32-bit als 64-bit architecturen. Het is ontwikkeld door Amit Saha met de steun van Fedora Science and Technology SIG. Mooi online documentatie zal je voorstellen aan Fedora Scientific en je begeleiden bij de software selectie.

Software-hoogtepunten: Maxima, een complete algebra-suite; LaTeX, voor het maken van documenten en presentaties; Mayavi, voor 3D-gegevensvisualisatie, en de versiebeheer Niet alleen voor codeerders: topversiebeheersystemen voor schrijversDe vermelding van versiebeheer of revisiebeheer maakt het iets voor geeks. Het zal u verbazen dat versiebeheersystemen niet alleen hun plaats hebben in academisch schrijven, maar ook in ... Lees verder trifecta: git, Mercurial en Subversion.

Je kunt Fedora Scientific Live DVD downloaden via directe download of als torrent.

Alternatief: Als je op zoek bent naar een gebruiksvriendelijke wetenschappelijke distributie die is gericht op wiskunde, Mathbuntu is een prima vervanging voor Fedora Scientific. Het is beschikbaar als een zelfstandige distributie of als een set pakketten voor uw huidige Ubuntu-installatie.

Ongeacht in welk wetenschappelijk gebied u geïnteresseerd bent, u zou een geschikte distributie uit deze lijst moeten kunnen kiezen. Terug naar die popquiz -wat is je favoriete wetenschappelijke Linux-distributie? Kun je andere soortgelijke distributies noemen die een plaats op deze lijst verdienen? Maak je huiswerk en deel je aanbevelingen in de comments.

Afbeeldingscredits:Uitgelichte afbeelding, Op Nagios gebaseerde monitoring wall in het NOC via Flickr door Docklandsboy, Schermafbeelding van Poseidon, Screenshot van CAElinux, Wetenschappelijke Linux via Wikimedia Commons, Schermafbeelding van Fedora Scientific.